词条 | foldit |
释义 | 简介Foldit就是这样一个程序,它打算用人类的解谜思维来代替计算机算法中的一部分决策,把确定蛋白质的最佳三维形状设计成一个游戏,使得人们在游戏过程中也能对生物科学做出贡献。在这个游戏中你可以不断调整蛋白质的三维形状,上传最高分和所得的三维体,参与世界排名,并且还能与游戏参与者进行即时聊天。 详细介绍Rosetta@home是一个基于伯克利开放式网络计算平台(BOINC)的分布式计算项目。该项目由华盛顿大学贝克实验室开发和维护,用于蛋白质结构预测、蛋白质-蛋白质对接和蛋白质设计的研究。截至2009年12月9日,全球共有8.2万台计算机是这一项目的活跃志愿者,平均执行速度达99万亿FLOPS。Rosetta@Home还开发了一款电子游戏Foldit,目的是通过众包(crowdsourcing)途径来实现上述研究目标。尽管这个项目很大程度上侧重于进行提高蛋白质组学方法的精确性和稳固性的基础研究,它也进行一些关于艾滋病、疟疾、癌症、阿兹海默病以及其他疾病的病理学的应用研究。 与其他BOINC项目一样,Rosetta@home使用志愿者的计算机中空闲的进程资源来执行单独的单元计算。计算结果会被发送到项目的中央服务器,经验证后存入数据库中。这个项目是跨平台的,支持多种不同的软件和硬件环境。用户可通过Rosetta@home的屏幕保护程序观看正在自己计算机上进行的蛋白质结构预测的情况。 除了疾病相关研究,Rosetta@home网络还是结构生物信息学中新方法的一个测试框架。这些新方法经Rosetta@home庞大且多样的用户群体使用后,若运行效果稳定,将会被用于其他基于Rosetta的应用程序,例如RosettaDock和人类蛋白质组折叠项目。新方法测试中的两个重要项目是蛋白质结构预测技术的关键测试(CASP)和交互作用预测的关键测试(CAPRI)。这两项测试实验分别用于评估蛋白质结构预测和蛋白质-蛋白质对接预测的最前沿技术。Rosetta@home稳居最重要的对接预测器之一,并且是现有最好的蛋白质三级结构预测器之一。 |
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