始创于宣统二年（1910），名为“鹊江高、初二等小学堂”， 校址在荻港街荷花塘畔。1916年，为全镇四所小学中的唯一一所公立小学，更名为“鹊江小学”。1929年改称“繁昌县第四区区立第一完全小学”。时年，教职员5人，学生103人，设初小、高小两个班。开国语，算术，常识、修身等课。1925年，改为县立“荻港国民小学校”。嗣后校舍重新修建，呈四边形，大门后为庭院、过道，占地约600平方米，开三个班（初小两班，四个年级；高小一班，两个年级，均为复式教学），学生约150人。其后，为六个班，学生240人，单班教学。1937年，抗日战争爆发，学校解散。1942年，于原校舍办繁昌县荻港镇小学。其时私塾停办，学校扩充。1945年10月，民国县政府接管该校，更名为繁昌县立荻港镇中心国民小学校，并于中街城隍庙后殿设分部，开初小两班（一至四年级，复式教学）。总计学生300余人。

1949年4月21日繁昌解放，人民政府接办，更名为繁昌县荻港中心小学，开12个班，学生650人，教职员工17人。1952年于青山冲万字会设分部，总部、分布计17个班，学生约900人，教职员工23人。1954年，洪水冲毁校舍，迁至万字会分部。1955年，开20个班，学生千余人，教职员工30人。

1958年，改名为“共产主义学校”，调庆大、石垅等乡村小学生集中到荻港住宿就读，参加“大办钢铁”。

1969年增设中学部，中小学合称“荻港五·七中学”。1972年，小学部迁址重建，1976年从中学剥离，恢复原校名。1984年，荻港镇与荻港公社合并，其时，该校更名为荻港镇中心小学。1986年，胜圩小学并入。

2006年，该校占地8400平方米，建筑面积3700平方米，教学楼两幢。藏书13000余册，有阅览室、自然实验室、158座的阶梯教室、64台计算机室、多功能活动室。15个教学班，学生800人，教师43人。

2001年，该校评为省“电化教学一类学校”。2006年5月获安徽省教育学会“中小学幼儿园师生文学书画大赛”最佳组织奖，县“女教师健身操比赛”三等奖，县“办学水平（目标管理）”二等奖，县“基础教育课程改革”先进集体。同年6月，学生王雨晴获安徽省“江淮好少年”，毛若翎获芜湖市“江城好少年”。