词条 | cgh |
释义 | 比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)是自1992年后发展起来的一种分子细胞遗传学技术,它通过单一的一次杂交可对某一肿瘤整个基因组的染色体拷贝数量的变化进行检查。其基本原理是用不同的荧光染料通过缺口平移法分别标记肿瘤组织和正常细胞或组织的DNA制成探针,并与正常人的间期染色体进行共杂交,以在染色体上显示的肿瘤与正常对照的荧光强度的不同来反映整个肿瘤基因组DNA表达状况的变化,再借助于图像分析技术可对染色体拷贝数量的变化进行定量研究。 比较基因组杂交优点CGH技术的优点:1.实验所需DNA样本量较少,做单一的一次杂交即可检查肿瘤整个基因组的染色体拷贝数量的变化。2.此法不仅适用于外周血、培养细胞和新鲜组织样本的研究,还可用于对存档组织的研究,也可用于因DNA量过少而经PCR扩增的样本的研究。CGH技术的局限性:CGH技术所能检测到的最小的DNA扩增或丢失是在3-5Mb,故对于低水平的DNA扩增和小片段的丢失会漏检。此外在相差染色体的拷贝数量无变化时,CGH技术不能检测出平等染色体的易位。 计算机生成的全息图概念CGH即Computer-GeneratedHolograms(计算机生成的全息图)。全息图的独特性质在于它能同时记录信息的强度和相位。传统的全息图是通过参考光束产生的干涉图样和一束成像目标反射的光束相干产生的干涉条纹记录形成的。自20世纪60年代末德国科学家罗曼提出计算机产生全息图以来,这项技术已成为信息光学的一个重要分支,并得到广泛的研究和应用。因计算机产生全息图不要求两束光发生物理相干而使过程简化。然而,在大规模集成电路制造方面,使用照相掩模和光刻技术制作全息图仍然存在自身的生产复杂性。 发展概况中国科学院上海光学精密机械研究所的研究小组已成功验证了一种计算机产生全息图的交替单步法(alternatesingle-step)。利用Spectra-PhysicsSpitfire公司的钛宝石激光器产生的800nm波长120fs脉冲将计算机产生全息图直写在玻璃基底的铝膜上,而不需要掩模或对基底进行事先或事后处理。 当基底在与入射光垂直的平面上移动时,通过一个10倍显微物镜聚集激光光束。用平均功率为1mW的激光束烧蚀直径为10?滋m的通孔,基底玻璃没有受到任何损坏。作为原理实验,该研究小组在3mm×3mm的基底上构造了128×128的小孔阵列。图为上海光学精密机械研究所的英文字母缩写的全息图,是透射和反射全息图的结果。 由于飞秒激光器适用于大多数基底材料,故这种技术为计算机产生全息图的更广泛应用敲开了大门。该研究小组计划通过优化那些用于特殊应用的基底材料的性状和刻写参数来提高衍射效率。目前,该研究小组正致力于研究利用飞秒激光器直接刻写的方法以简化全息图的产生过程。 光互连中一种新的计算机生成全息图方法:首先以光互连中探测平面(像平面)的多光点分布为例,采用模拟退火方法计算了其二元傅立叶变换全息图和四相位傅立叶变换全息图,然后以傅立叶变换性质为基础,提出了一种逆向求解全息图方法。在该方法中,将光点分布图作为全息图的傅立叶变换面,每个光点由全息面中特定空间频率的正弦光栅的傅立叶变换形成,各正弦光栅的空间频率由探测平面的光点坐标(互连关系)决定,全息图则为一系列正弦光栅的线性迭加。该方法具有计算速度快,光互连定位准确的优点。 |
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