光绪三十二年（1906年），尚干里人林履端从江西东乡知县任上告老还乡，创办陶南小学，校址设在林氏祠堂。校长是举人林翰西，学生100多人，分设甲、乙、丙三个班。民国6年，县政府定校名为闽侯县第七区第一高小国民学校。民国23年，国民政府主席林森个人捐资在尚干道头建工字型砖木结构12间教室，并有大礼堂、单层校舍。陶南小学、乡师附小隧并入新校舍上课。民国35年改称为县立尚干中心小学。民国38年，开设7个班，学生300多人，教师13人。

1949年8月17日，福州解放，人民政府接管了尚干中心小学，留用校长林亨淦，续用教师13人，仍设7个班，学生300余人。1951年，闽侯县政府迁址尚干，县政府机关借用小学校舍，尚干小学搬入东升百草大厝上课，改名闽侯县实验小学，校长李维才。1953年，县政府迁往螺洲，尚干小学迁回原址，恢复校名尚干中心小学，副校长林逸生。1958年，在反右斗争后，尚干中心小学的行政人员进行整顿，县政府派王菊萍任校长。1960年后，建立学区党支部，书记潘秋林兼尚干中心小学校长。翌年，潘秋林调离后由林伯瑞任书记，兼任尚干中心小学校长。1962年，学校建红砖楼，扩大填高操场，拓宽校园，设16个班，学生900余人，教师28人。

1966年6月文化大革命开始，尚干中心小学出现几面选择旗帜，师生冲出课堂，停课闹革命，学校全面瘫痪，动乱延续4年。1970年秋，县小教学习班结业后，调方在福任尚干中心小学校长（当时称教革组组长），少数原教师留任。1972年，方在福调离，由林寿钦任校长。

1973年，祥谦学区党支部副书记林寿钦兼任尚干中心小学校长，他上靠党委，下靠教师，着手克服派性，建立正常教学秩序。1979年秋，县委重建祥谦学区，党支部书记林伯瑞。是年，尚干中心小学群策群力，建一座砖木结构3层18间教室的教学楼。次年又建一座砖木结构2层8间教室的教学楼，及一个面积350平方米的礼堂，并改建厨房、厕所和一个60平方米的跑道和田径场，校园面貌改观。此时设20个班，学生988人，教师32人。1982年9月，学区体制变动，学区书记不再兼任中心校校长，县教育局任命陈敦明为尚干中心小学校长。1983年3月，祥谦公社分为两乡一镇，祥谦学区分为祥谦、青口两个学区，陈敦明调离，县教育局任命柯淑芬为校长。是年，于校园北侧建混合结构3层9间教室的教学楼。1984年，在教学方面打破“三个中心”的传统教学法，积极开辟第二课堂，组织32个兴趣小组。是年秋，县教育局任命甘亨森为祥谦学区党支部书记、校长。同年冬，福州市三个面向现场会在尚干中心小学召开。1985年，尚干中心小学被省人民政府授予先进单位称号。1986年，柯淑芬退休，教育局任命甘亨林兼任尚干中心小学校长。1993年，县政府同意分立尚干学区，尚干中心小学和祥谦小学归属尚干学区，学区书记甘亨森。此时全校有28个班，学生1400人，教师60人。2004年，尚干镇出面筹资造1座5层教学综合大楼1000多平方米，同年，经上级政府批准，改称尚干镇中心小学。