闽侯旗山地震地下流体观测站位于南屿镇五都村小学北面，地理坐标东经119°10'35"，北纬25°59'51"，海拨高度10米。于2003年8月15日开钻，9月6日终孔，终孔深110.69米，日出基岩水50吨以上；终孔口径110毫米，孔至强风化层下入Ø146毫米套管。

闽侯旗山井地质：由燕山期花岗岩和晚侏罗世、白垩纪火山岩组；盆地底部为中更新世棕红——褐黄色含碎石的砂质粘土层或残积土层，最厚达十余米，局部缺失，不整合地覆盖在基岩之上；盆地内部晚第四纪堆积物属海湾溺谷型的河——海交错沉积相（冲、海积相），沉积种类繁多，结构复杂，以存在3层灰黑色淤泥为特点，一般沉积厚度20——60米，最大厚度65米左右。

观测房建筑面积13.75平方米，层高3米，单层框架结构，2003年10月15日开工，2003年12月5日竣工。

避雷设施的建设采用法拉第笼式建设，工程2003年12月5日开工，2003年12月15日竣工。接地电阻2欧，符合地震观测仪器的接地地线电阻小于4欧的技术要求。

监测设备委托省地震局向中国地震局定购，仪器由中国地震局专家黄锡定及福建省地震局专家于2004年2月1日安装。观测站现场安装仪器为：DQS-4型地震前兆公用数字化设备一套、LN-3型数字水位仪一套、RTP-1型雨量气温气压观测仪等设备；闽侯县地震办公室监测预报室安装了有线通讯主单元一套、GPS卫星接收机一台等，并与计算机连接，当天就可以接收到来自旗山地震站的观测数据，每天采集一次数据，经处理后记录备案。福建省地震局、福州市地震局台网中心也可直接采集旗山地震观测站的数据。