1964年6月成立临清县气候服务站，当时隶属于山东省气象局领导，站址位于临清市东郊，东经115°43′，北纬36°51′，观测场海拔高度36.7米。

根据相关文件精神1966年1月更名为临清县气象服务站。1970年7月划归临清县革命委员会和人民武装部领导，以武装部领导为主，业务归山东省气象局管理。1974年6月更名为临清县革命委员会气象站。1976年11月更名为临清县革命委员会气象局，归临清县革命委员会领导。1981年1月更名为临清县气象局，由山东省气象局和临清县人民政府双重领导，以部门领导为主的正科级科技事业单位。1984年因临清县改为临清市，临清县气象局更名为临清市气象局。1985年更名为临清市气象站。1989年2月再次更名为临清市气象局并沿用至今。

2000年1月1日因探测环境保护需要迁址到城南郊三里堡村北面济津渠北侧，观测场位于东经115°42′，北纬36°49′，海拔高度34.0米。

局里下设办公室、业务科、临清市消雹增雨领导小组办公室、临清市雷克气象服务中心。至2008年底在职干部职工共8名。其中本科4人，专科2人，中专2人；40岁以下2人，40－49岁4人，50岁以上2人；中级专业技术人员5人，初级专业技术人员3人。