济宁医学院神经生物学研究所成立于1989年5月，现有研究人员15名，其中教授4名、副教授3名、讲师4名、助教4名，拥有分子生物学实验室、细胞培养室、电生理学实验室、BL-420生物机能系统实验室、放射免疫实验室等，具有较完备的实验条件和实验设施。该研究所以神经生理学专业为主线，在加强神经生理学基础研究的同时，紧紧围绕神经生理学的应用基础研究领域，主要涉及神经激素与中枢神经系统损伤、中枢神经递质与针刺镇痛、中枢神经递质与心血管活动的调制三个不同的研究方向。

研究所承担并完成国家自然基金、山东省科技攻关、山东省自然基金等10多项上级科研课题的研究工作，已结题鉴定的科研成果达到国内领先或国际先进水平，并多次获省部级等上级科研成果奖励，如“中枢神经降压素在针刺（电针）镇痛中作用的实验研究”获国家中医药管理局中医药基础研究奖（部级）三等获、“内源性阿片肽在沙土鼠急性缺血性脑水肿中作用的实验研究”获山东省科学技术进步二等奖。在《Biochimica et Biophysica Sinica》、《Neuroscience Bulletin》、《Neuroscience Research》、《Life Sciences》、《生理学报》、《中国应用生理学杂志》、《中国神经科学杂志》等多种学术刊物上发表相关研究论文100多篇，其中多篇论文获得全国、省优秀科技论文一、二、三等奖励，并多次参加国内外学术会议，受到国内外同行专家的重视，在国内产生了一定的影响。