主要职责：

内设机构：

主要职责：

负责环境保护方面的区划、规划编制和基础能力建设。拟定环境功能区划和环境保护规划、投资、经费预决算、财务、国有资产管理、内部审计等方面的部门规章、制度，并监督执行。参与制定国民经济与社会发展规划和主体功能区规划。组织编制综合性环境功能区划和环境保护规划，审核专项环境功能区划和环境保护规划。组织实施环境保护目标责任制。组织审核城市总体规划和其他部门规划中的环境保护内容。负责提出环境保护领域固定资产投资规模和方向、国家财政性资金安排的意见，审批、申报国家规划内和年度计划规模内固定资产投资项目，并配合有关部门做好组织实施和监督工作。负责国家重大环境保护项目、能力建设项目、基本建设项目等的组织实施和监督管理工作。审核派出机构、直属单位固定资产投资项目。组织实施国家环境监测网和全国环境信息网能力建设。组织协调相关固定资产投资项目竣工验收。管理并监督基本建设、政府采购（招投标）工作。管理环保项目进出口减免税工作。组织编报、审核汇总、批复预决算。负责国库集中支付、国有资产、住房制度改革等管理工作。承担部机关财务管理、各项经费会计核算和资产管理工作。审核报批环境保护系统收费项目和标准。负责归口联系西部开发、中部地区崛起、振兴东北老工业基地、扶贫、治乱减负等工作。负责环境保护经济体制改革工作。组织参与宏观经济形势分析工作。组织编制利用外资计划。负责绩效考评和内部审计工作。

内设机构：

1、综合处

　承担司内文电、会务、机要、保密、安全、印章、档案、财务预算、固定资产管理、政务信息与公开、工作计划与总结等综合性事务和综合协调工作；审核报批环境保护系统各类收费项目并监督执行；组织编制环境保护系统利用外资计划；联系西部开发等专项相关工作；承担环境保护经济体制改革工作；组织参与宏观经济形势分析工作。

2、规划区划处（简称规划处）

　参与制定国家主体功能区规划；拟订环境功能区划、环境保护规划方面的规章、制度，并监督执行；组织编制、评估、考核综合性环境功能区划和环境保护规划；审核专项环境功能区划和环境保护规划；组织实施环境保护目标责任制。

3、预算处

　拟订预决算管理、经费管理等规章制度并监督执行；组织编报、审核汇总、批复预决算；承担各项经费使用的监督管理和绩效考评工作；协调中央财政专项资金的申报审批工作；承担国库集中支付、银行账户、非税收入等管理工作。

4、投资处

　提出和协调环境保护领域国家投资方向、规模和渠道；审批和申报国家规划内相关项目及年度投资计划；组织实施和监督管理国家重大环境保护项目、能力建设项目和基本建设项目；管理并监督政府采购工作。

5、财务处

　拟订部机关财务、资金管理内部控制、国有资产管理等规章、制度，并监督执行；承担部机关财务、资产管理和各项经费的会计核算工作；承担部机关、派出机构、直属单位国有资产管理工作；承担住房制度改革工作。

6、内部审计办公室（简称内审室）

　拟订内部审计的规章、制度，并监督执行；联系审计署开展审计工作；承担部机关及派出机构、直属单位内部审计工作。