湖州地处长三角中心区域，是沪、杭、宁三大城市的共同腹地，是连接长三角南北两翼和东中部地区的节点城市。湖州市总工会现辖三县两区总工会（德清、长兴、安吉县，吴兴、南浔区）、十个产业工会；72个乡镇（街道）工会，其中有13个镇总工会；截止至2009年9月，全市共有基层工会6803家，职工总数584920人，会员总数561284人。湖州市总工会下辖吴兴、南浔、德清、长兴、安吉五个县（区）总工会和10个产业（局、公司）工会（工作委员会）。

湖州市总工会机关职能机构有五部一室：办公室、组宣工作部、经济技术工作部、权益保障部、财务部、女职工工作部（含经审办）；三个驻会产业：市财贸工会、市教育工会、市直属基层工会（开发区工会工作委员会）；四个下属事业单位：市总工会职工技协办公室、市总工会职工维权帮扶中心、市总工会工人文化宫、湖州职工中等专业学校（湖州市财会学校）。