湖州蚕桑科学研究所成立于1978年10月，原名为浙江省嘉兴地区蚕桑科学研究所，是经浙江省政府批准成立的正县级全民事业单位。因撤地建市，于1984年更名为浙江省湖州蚕桑科学研究所。2004年6月与原湖州市农业科学研究所合并成立湖州市农业科学研究院后，内设蚕桑科学研究所，保留浙江省湖州蚕桑科学研究所的牌子，是目前国内二个地市级蚕桑研究所之一。现有在职职工32人，其中高、中级专业技术职称13人，下设4个学科和研究室、良繁中心，建有蚕桑科研和生产两个基地，拥有科研用房和生产辅助等用房1万多平方米、品种桑园30亩、专业用桑面积250亩、原蚕生产基地2个，可年产蚕种5万多张。

湖州蚕桑科学研究所以桑、蚕、茧、丝为主要研究对象，以应用、开发研究为主，承担国家、省、市及有关单位委托的研究与开发任务。主要从事蚕、桑新品种的选育和引进、示范、繁育、推广；蚕桑分子生物技术应用和蚕桑资源综合利用；家蚕人工饲料的开发与应用研究；高效省力化养蚕和桑、蚕病虫害防治等实用技术的研究。承担全国和浙江省家蚕新品种的实验室鉴定任务、湖州市农村一代杂交种的生产任务和蚕种、蚕药质量的检验及桑叶氟化物的检测任务。具有为广大基层蚕桑干部培训、为蚕农服务的雄厚技术力量和配套设施。

建所以来，已先后联合或独立完成各级科研和推广项目57项，其中已获部、省、市级各类科技成果等奖项38项；国家发明专利1项；撰写发表科技论文200余篇；出版专著2部；自主育成2对家蚕新品种，在生产上得到了大面积推广应用，累计推广25万张；合作育成家蚕新品种1对，在全国推广300万张，取得了显著的经济社会效益。为湖州蚕桑的持续发展和农民增收、农业增效作出了重要的贡献。