海军上海保障基地组建于1969年10月14日，由原淞沪水警区、陈家港巡防区、登陆舰第五支队、护卫舰八大队、修接船管理支队和第411医院等单位组成，隶属东海舰队建制领导，执行正军级权限。体制编制先后历经三次重大精简调整后，现为正师级保障基地，使命任务由以辖区作战防御为主转为以辖区海军兵力后勤装备保障为主。

基地原所属部队先后参加过解放嵊泗列岛、大陈岛、一江山岛等10多次登陆作战和海上剿匪战斗，参与了援越扫雷作战、“阿波丸”沉船打捞和首次向南太平洋发射运载火箭试验、首次赴南极科学考察等重大行动，涌现出了洛阳舰、沂蒙山舰和“扫雷先锋”夏三宝、“永不熄灭的灯光”萨本茂、“海上铁人”赵信广等一批英模典型，曾受到毛泽东、邓小平、江泽民等党和国家领导人的接见或检阅。基地全体官兵正满怀坚强的决心和信心，牢记使命、真抓实干，团结一致、锐意进取，为建设强大的人民海军作出新的更大贡献。