敦煌研究院学术委员会是主管全院科研管理工作的职能部门。学术委员会的主要职能是掌握全院科研工作的基本情况，了解学术动态，对科研工作的研究方向、任务、学科的调整和设置提出分析与建议；组织制定院年度及中长期科研规划；组织实施院级科研课题的评审及省（部）级和国家级科研课题的申报工作；组织落实重大科研项目的实施；审核院属研究机构的学术活动计划，组织全院的学术活动和学术会议；组织重要科研成果的鉴定和优秀科研成果的评奖；负责管理院学术著作出版基金及出版资助工作；负责科研业务的院外联系和科研成果的宣传工作。