清同治六年(1867年)五月初五，求是堂艺局迁至马尾后，按专业进行分班，因航海专业校舍设在船政衙门南侧后部，遂称船政后学堂。学堂设有驾驶专业，学制5年，开设英语、算术、几何、代数、直线和球面三角、航海天文气象，航海算术和地理，采用外国教材。专业实习课有舰船驾驶和演炮。光绪七年(1881年)前后，增设轮机专业，学制5年，学习课程有算术、几何、设计、蒸汽机结构、操纵维护船用蒸汽机、使用仪表、监分计等。同时，进行实际安装操作，使学生初步掌握管轮的知识和实际经验。至光绪三十四年，驾驶班共毕业学生19届241人。至宣统三年(1911年)轮机班学生共毕业11届545人。

民国2年(1913年)10月，船政后学堂改称福州海军学校。民国9～13年，原船政后学堂招收的最后三届轮机班学生共毕业84人。