由《黄帝内经》奠定的藏府经络说，指的是中医关于人体脏腑经络生理功能、病理变化及其相互关系的基本理论。藏府包括：（1）五藏：肝、心、脾、肺、肾；（2）六府：胆、胃、小肠、大肠、三焦、膀胱；（3）奇恒之府：脑、髓、骨、脉、胆、女子胞（《素问·五藏别论》）。经络包括：（1）十二经脉，又称正经，由手三阴（太阴、少阴、厥阴，分别经肺、心、心包），足三阴（分别经脾、肾、肝），手三阳（阳明、太阳、少阳，分别经大肠、小肠、三焦），足三阳（分别经胃、膀胱、胆）组成，阴属藏而络府，阳属府而络藏；（2）奇经八脉：冲、任、督、带、阴蹻、阳蹻、阴维、阳维，参互于十二经脉间，沟通、调节人体气血、营卫。元人以任、督二脉各有专穴，与十二经脉并合为十四经，且谓六阴汇于督，六阳汇于任。（3）十二经筋，为十二经脉气散于筋肉的部分（《灵枢·经筋》）。《内经》谓“心主身之血脉”，气血“总统于肺”，血赖气而运行，气血病变互有影响，水谷精微之气散诸肝，精气浓浊部分上至于心。藏府之变化，往往通过经络反映到肤表之腧穴。《内经》此说基本上包括了呼吸、循环、消化、神经系统的相互关系，比诸公元二世纪罗马医学的血液如潮汐之说，先进得多。