东晋永和十一年(355)，划郪县东部和广汉县濒涪，郪两江地区置巴兴县。县治设四川今蓬溪县灵鹫山，属遂宁郡。

刘宋泰始五年(469)，改遂宁郡为东遂宁郡，巴兴县属之改。

西魏恭帝二年(555)，分东遂宁郡置怀化郡，改巴兴县为长江县属之。长江县以境内有大江(涪江)故名。

北周闵帝元年(557),,改东遂宁郡为石山郡，长江县属之。

隋文帝开皇三年(583)，撤郡留州，以州辖县。长江县属遂州。

炀帝大业三年(607)，改州为郡，以郡统县，遂州改为遂宁郡，长江县属遂宁郡。

唐高祖武德元年(618)，行州统县制。遂宁郡更名遂州，长江县属遂州。

宋徽宗政和五年(1115)，升遂州为遂宁府。长江县属之。

元世祖至元十九年(1282)，长江县人口锐减，土地荒芜，并入蓬溪县。