帝国历１６４年，自由行星同盟国父──亚雷．海尼森带领共和主义者们长征一万光年，在帝国历２１８年到达了壮年期星群的地带，并在此建立了根据地，「自由行星同盟」成立，以共和民主政治的形式，对抗银河帝国的独裁帝政，时值宇宙历５２７年。　宇宙历７９９年，尚未篡位登基的莱因哈特．冯．罗严克拉姆公爵，以帝国宰相兼帝国三长官之姿，远征自由行星同盟，同盟国在城下之盟的情况下与银河帝国签订了「巴拉特和约」，自由行星同盟名存实亡。宇宙历８００年，新皇帝莱因哈特以银河帝国高等事务官雷内肯普被俘自杀一事为由，向自由行星同盟再次用兵，同盟军在马尔．亚迪特星域被帝国军歼灭。其后皇帝莱因哈特在同盟国立美术馆公布了「冬蔷薇园敕令」，宣布自由行星同盟正式灭亡，国祚二百七十三年。

帝国历一六四年，被降为奴隶阶级的叛徒家属们，也就是被流放至牛郎星（天鹰座α）上从事严苛劳动的共和主义者们，使用自己建造的太空船，成功地完成逃亡行动。

劳工们在青年 亚雷·海尼森 的带领下，用干冰在无名的地下秘密建造了八十艘太空船，凭借着超人的耐心和毅力完成了这一巨大的工程。

“到一个自由的世界去吧！”

于是，寄托了梦想的太空船载着这些逃亡者踏上了艰难而漫长的旅途，后世称此壮举为“长征一万光年”。

在苦难的旅程途中，他们失去了敬爱的领导人——海尼森。海尼森的好友 古恩·基姆·霍尔 接下他的棒子。当他渐渐衰老、双眼失明时，他们终于脱离了危险地带，进入了安定的壮年期恒星群。而自牛郎星出发至今，已过半个多世纪了。

五十多年后，逃亡者们的双脚终于踏上了自然行星的地表。这是一个自由的宙域，与其说是没有了压迫者，倒不如说是荒无人烟。

新天地里的星群以古代腓尼基诸神的称呼为名，如：巴拉特、亚斯堤、梅卡特、哈达德等等。他们以巴拉特的第四行星为根据地，并以亡故的领导者海尼森之名为名，以缅怀他的不朽功绩。在最高评议会大楼前竖立着一座巨大的铜像——“国父 亚雷·海尼森”。

宇宙历五二七年，自由行星同盟宣告成立。当年，废除帝国历，恢复宇宙历，共有市民十六万人。

在之后的数百年间，银河帝国与自由行星同盟之间持续不断的发生战乱。　

宇宙历640年，银河帝国出兵讨伐自由行星同盟，名将 林·帕欧 和 尤斯夫·托波洛 奉命迎击帝国军，上演了著名的“达贡歼灭战”。宇宙历745年，以 布鲁斯·阿修比 提督为首的“730年党”连战连胜，在“第二次迪亚马特会战”中击毙了多名帝国军将领，但不幸的是，阿修比提督在胜利的最后关头战死，死后晋升为元帅。帝国军的伊谢尔伦要塞建造完成之后到自由行星同盟灭亡，同盟军先后对伊谢尔伦回廊进行了十次军事行动，包括同盟军统合作战本部长 西德尼·席特列 元帅在内的众多将领都始终无法突破伊谢尔伦回廊，但是被称为“魔术师杨”的 杨威利 元帅却两次占领了伊谢尔伦要塞。后来，宇宙历788年，发生了领杨威利一夜成名的“艾尔·法西尔大逃亡”。

宇宙历796年，在第七次伊谢尔伦攻略战中，杨威利少将利用帝国军中要塞司令官与驻留舰队司令官之间的不和，兵不血刃的占领了伊谢尔伦。在此之后，被胜利冲昏头脑的同盟国防委员们在准将 安德鲁·霍克 的蛊惑下，国防委员长 优布·特留尼西特 动员了三千万大军在补给不足的情况下远征帝国，结果在“亚姆立扎会战”中惨败。统和作战本部长席特列元帅引咎辞职，由刚刚晋升为上将的 库布斯里 提督和 比克古 提督分别担任统和作战本部长和宇宙舰队司令官。

宇宙历797年初，表面上为了配合皇帝 艾尔威·由谢夫二世 登基而大赦天下，事实上为了给即将到来的大选作准备，同盟政府决定与帝国进行俘虏交换仪式。双方共计四百万名俘虏在伊谢尔伦要塞换乘到各自回国的舰队上，而帝国军间谍、前同盟上将 林奇 混在俘虏中，秘密潜入了首都海尼森，成功策动了一系列叛乱，其中就包括以同盟军总参谋长 德怀特·格林希尔 上将为首的“救国军事会议”。杨威利的第十三舰队奉命镇压各地的叛乱，击溃了叛乱的第十一舰队，摧毁了首都防空系统“女神的首饰”攻击卫星，终于夺回了海尼森。在此期间，库布斯里上将遇刺受重伤入院治疗，刺客正是霍克准将，此时的他已被诊断患有严重的精神病。国防委员会决定由 德森 上将代理统合作战本部长之职，后来和比克古提督一起遭到叛军软禁直至第十三舰队占领海尼森。叛乱最终以失败告终，林奇上将（被帝国军授予中将军衔）因事情败露而被杀，格林希尔上将在“救国军事会议”的内讧中被杀，代理议长 艾凡思 提督在投降后自尽。年底，帝国军一级上将 梅尔卡兹 提督逃亡到自由行星同盟，在杨舰队担任客座提督，享受中将待遇。

宇宙历798年，因害怕杨威利依靠在市民中极高的声望而成为独裁的军阀，同盟政府将杨召回海尼森并企图通过虚构的“审查会”迫害杨。当得知帝国军携“秃鹰之城”要塞进攻伊谢尔伦要塞时慌忙将杨释放并命其率领增援舰队回援伊谢尔伦。由于留守的代理司令官 亚历克斯·卡介伦 少将指挥得当，才避免了要塞被帝国军占领，一直坚守到杨回到伊谢尔伦，最终击退了帝国军的进攻，并摧毁了“秃鹰之城”要塞。而后，幼帝 艾尔威·由谢夫二世 被旧贵族绑架而流亡到自由行星同盟，并在同盟政府的扶持下在海尼森建立了流亡政府——“银河帝国正统政府”。于此同时， 尤里安·敏兹 被授予少尉军衔，前往费沙自治领就任“驻在武官”。然而， 在尤里安上任没多久，帝国军就占领了费沙，同盟大使、首席驻在武官等人仓皇出逃，尤里安机敏的在帝国军攻陷大使馆前销毁了计算机中的数据，并设法拖延敌军的攻势，最后成功的躲藏了起来，避开了帝国军的搜捕。

宇宙历799年初，亚历山大·比克古提督晋升为元帅，邱吾权上将出任参谋长，奉命率领各地的治安部队迎击帝国军。与此同时，杨威利得知帝国军取道费沙入侵的消息，随决定放弃伊谢尔伦要塞，并封印了“雷神之槌”主炮，立刻调头回援比克古舰队。由于兵力相差悬殊，比克古提督战败，直到杨的第十三舰队抵达才得以解围。在短暂的修整中，尤里安抢得一艘帝国军的驱逐舰逃离费沙，此时已经与杨舰队会合，尤里安因勇敢的行为被晋升中尉。此战之后，杨舰队的所有成员集体晋升一级，此时的杨威利已是元帅了。面对强大的帝国军，杨连续击败了敌军三位名将，迫使莱因哈特皇帝陛下亲自出战，在巴米利恩星域会战中给予莱茵哈特本队痛击，并差点击毁了帝国军总旗舰，但因敌军援兵抵达战场和首都陷落，首脑部下令放弃抵抗而没能实现。此时，应杨的请求，梅尔卡兹提督带领杨舰队中的一小部分战力展开代号为“移动的谢伍德森林”的游击战。

随着《巴拉特和约》的签订，自由行星同盟彻底沦为了帝国的殖民地，杨威利和杨舰队的高级幕僚们以及比克古等众位提督退役。已是议长的优布·特留尼西特下台，财政委员长 姜·列贝罗 出任议长。在帝国的要挟下，同盟政府被迫销毁仅剩的1000艘战舰，然而却被梅尔卡兹提督的舰队劫走，并有大批参与销毁的将兵倒戈到梅尔卡兹提督麾下。由于帝国的暗示，同盟首脑部决定秘密杀害已经退役的杨威利以及杨舰队的成员，不料杨却被先寇布中将麾下的“蔷薇骑士”连队所救，而列贝罗议长和帝国驻同盟高等事务官被劫为人质,并迫使高等事务官雷内肯普自尽。在杨和他的原幕僚率领下，重组的杨舰队离开海尼森，与梅尔卡兹舰队会合，并再次攻陷伊谢尔伦要塞。邱吾权参谋长要求姆莱等人带领同盟军的一半主力投奔杨，姆莱等人立即出发。

宇宙历800年，帝国军以高等事务官被害为由，再次进攻同盟，比克古提督恢复现役，毅然再次率军迎击帝国军，在重创敌军后终因寡不敌众而战死，邱吾权参谋长也一并壮烈殉国。同盟首都海尼森被帝国军占领，议长姜·列贝罗被叛乱的军官杀死。

宇宙历800年二月二十日，《新帝国历二年二月二十日的敕令》颁布，延续了二百七十三年的自由行星同盟正式宣告灭亡。国父海尼森所主张的：“自由、自主、自律、自强”的宣言被永远尘封在历史的长河中。