导致与一某一物殊基因正常的两个成对等位基因出现不同的基因组变化；常反映丧失该基因的一个等位基因的部分或全部基因组序列。LOH与存在肿瘤的抑制基因（如p53）有关。在两个等位基因都存在的况，会导致抑制恶性肿瘤的发生。而当一个等位基因明显异常或缺失时，不再发生抑制亚性状态，细胞就转化为癌细胞。