1924年2月15日生，祖籍镇海大碶。1950年毕业于北京大学地质系。现任中国地质大学教授，中国矿物岩石地球化学学会常务理事兼地球化学区域地球化学专业委员会主任委员，中国地质学会勘查地球化学专业委员会名誉主任委员，中国大地测量与地球物理全国委员会委员，中国地球热力学与动力学数据委员会常务委员，地质矿产部科学技术委员会委员。1995年当选为中国科学院院士。

为了发展我国的地质科学，於崇文跑遍了祖国的山山水水，与石头打了半个世纪交道。

於崇文早年提出“地质作用与时——空结构是地质现象的本质与核心”的理论观点，并以耗散结构理论为基础建立新的地球化学理论体系与方法论，应用于区域地球化学和矿床地球化学研究，开辟了地球化学学科发展的新方向。他在我国率先研究“成矿作用非线性动力学”，揭示成矿作用的驱动力、进行的速率和机制及其时间演化和空间展布，开拓了矿床成因理论和成矿规律研究的新领域。

於崇文性格开朗、工作执着，认定要做的事情一定要把它做好。“文革”十年期间，尽管遭受磨难，他还继续研究，跑图书馆，硬是记下了几十万字的笔记。

近年来，於崇文又将复杂性科学应用于地球系统，提出“固体地球系统的复杂性与自组织临界性”的新命题，并应用于矿产资源研究，发现“大型矿床和矿集区在混沌边缘”，是矿床成因理论和成矿规律研究上的一项重大突破。最近他又将上述命题拓宽并推广到广义地质作用和整个地质系统，提出地球科学的复杂性理论：“地质作用的自组织临界过程动力学——地质系统在混沌边缘分形生长”，并将它应用于中国东部壳——幔系统的复杂性探索。在我国系统全面地引进数学地质的理论和方法，促进了地质科学的定量化。

於崇文的代表作有《南岭地区区域地球化学》、《云南个旧锡——多金属成矿内生成矿作用的动力学系》和《数学地质的方法与应用》等5部，还有数十篇论文。他的研究成果获国家级和省、部级一、二等奖10项，1991年被授予我国地质科学最高奖-李四光地质科学奖。