巫头岛隶属于广西东兴市，在祖国南疆的海防线上，面临南海的北部湾，背倚十万大山，与越南仅一水之隔。巫头岛与越南近在咫尺，鸡犬相闻，涉水可渡。它是京族聚居地京族三岛（万尾、巫头、山心三岛）之一，它们是由海水冲积而成的沙岛。其中巫头岛海拔只有8米，万尾岛面积最大，为13.7平方千米，巫头岛最小，只有5.13平方千米。“三岛”与大陆距离很近，退潮时可徒步往来，20世纪60年代，因为围海造田和筑堤引水通过人工填海，已与大陆相连，海岛变成了半岛，目前岛屿已与大陆相连。

巫头岛所在的京族三岛地处亚热带，全年最高气温为摄氏34度，最低摄氏3至4度，年平均气温为摄氏21.5度至28.3度，年平均降雨量1300毫米，是个“草经冬而不枯，花非春也常放”的地方。岛上夏季虽然气温偏高，但由于雨量充沛，加上有海风调剂，所以不仅不干燥炎热，而且凉风习习，清爽宜人，是一个避暑胜地。

同时岛上自然资源丰富，南面的北部湾是著名的渔场，盛产鱼、虾、蟹、贝等各种海产品，有鱼类700多种，其中经济价值较高、产量丰富的达200多种。珍珠、海马、海龙是医药上的名贵药材。北部湾海水含盐度达31%以上，适宜于制盐业的发展。除渔业外，还种植水稻、红薯、花生、芋头和玉米等。盛产香蕉、木瓜、黄皮果、龙眼、菠萝蜜等亚热带水果。沿海还生长有被称作“海底森林”的红树(海榄)，树皮含有鞣革的单宁酸，是重要的工业原料。竹山等地有铁矿、独居石。万尾岛与巫头岛有钛矿、磁铁矿、锗石英和玻璃砂等矿。