万慧军2003年7月，西北大学理论物理专业硕士研究生毕业，获理学硕士学位。

研究方向：量子光学与量子信息学。导师：杨志勇教授、胡晓云教授。

硕士学位论文：新型三态叠加多模叠加态光场的广义非线性等幂次与不等幂次高次压缩特性研究，西北大学，2003年3月；该论文为中国优秀硕士学位论文。

万慧军现为江西省井冈山学院副教授，校学术带头人。