分类地位：外囊菌目（Taphrinales）是真菌门、子囊菌亚门、半子囊菌纲的1目。C·L·克雷默（1973）主张本目仅包括外囊菌科1科，但也有人主张取消原囊菌目，将原囊菌科和外囊菌科作为外囊菌目的两个科。

繁殖：无性繁殖主要是由子囊孢子直接芽殖形成芽孢子，芽孢子可重复芽殖或萌发生菌丝体，但在人工培养基上不能形成菌丝体，只形成酵母状菌落。有性生殖由菌丝细胞双核化后形成产囊细胞，在产囊细胞内进行核配，此时细胞开始伸长并渐渐形成子囊，一般出现在寄主植物角质层下的栅状层中。

危害：本目成员均为植物寄生菌，为害高等植物和蕨类植物，引起组织变形，如缩叶、皱叶、囊果、泡肿和丛枝等症状。其中著名的如引起桃缩叶病的畸形外囊菌。外囊菌属的其他一些种还可引致栎树、樱桃的缩叶病；杨树、桃树的叶泡肿病；桦树、樱桃、李的丛枝病；李的囊果病等。