宫口港　位于涵江镇宫口内河，水域长400米，宽11米。1932年建成货运驳岸一段，长300米，前沿水深0.8米，10个泊位，可靠泊3～4吨级沟船。1940年建成长12米、可泊5吨级的汽船码头1个。1990年货物吞吐量1.8万吨，客运量17万人次。

水关头港　位于城关水关头。有简易客运码头1座，长14米，前沿水深1米；5吨级泊位2个。1990年货物吞吐量1.8万吨，客运量17万人次。

黄头港　位于城郊乡木兰溪北渠的下林村。水域面积900平方米，有简易码头1座，长20米，前沿水深0.8米，停泊能力5吨，为莆田糖厂专用码头。1990年吞吐量3.94万吨。

岭头尾港　位于东圳水库坝头西侧。有简易码头1个，长60米，宽6米，前沿水深52米，为东圳水库内的客运码头。泊位5个，靠泊能力15吨，航线总长15公里，年客运量20.6万人次。