钟山书院以南京东郊钟山而得名，初设于雍正二年（1724年）。由两江总督查弼纳创建。停办后于道光九年（1829年）重建。1853年太平天国时期停办。1864年清克南京城后两江总督曾国藩重建。1903年，改为江南高等学堂。

历任山长

杨绳武

夏之容

卢文弨

钱大昕

姚鼐

胡培翚

陶澍

唐鉴

李联琇

梁鼎芬

缪荃孙