牡丹江上游黑斑狗鱼国家级水产种质资源保护区总面积2987公顷，其中核心区面积684公顷，实验区面积2303公顷。核心区特别保护期为全年。保护区坐落在吉林省东北部延边朝鲜族自治州敦化市境内，地处长白山东北麓，张广才岭东南麓，牡丹江镜泊湖上游20公里处的雁鸣湖镇内。保护区位于牡丹江一级支流塔拉河流域及雁鸣湖水库，范围在东经128°32′04″-128°38′49.5″，北纬43°41′43.9″-43°48′35.3″之间。保护区东侧由北向南为塔拉后屯桥东（128°32′24.0″E，43°48′26.1″N）-林地（128°31′12.4″E，43°47′58.9″N）-塔拉前屯东岸（128°32′0.6″E，43°47′18.3″N）-菜屯东岸（128°33′57.6″E，43°46′09.5″N）-湖北桥东（128°33′43.2″E，43°45′31.6″N）-大山水库上端（128°34′51.3″E，43°44′07.22″N）-大山水库石咀子（128°34′57.2″E，43°42′51.5″N）-大山水库东弯（128°35′37.2″E，43°42′21.1″N）-大山水库大门（128°38′49.5″E，43°41′43.9″N）。保护区西侧由北向南为塔拉后屯桥西（128°32′04.0″E，43°48′35.3″N）-塔拉前屯（128°31′59.4″E，43°47′39.9″N）-菜屯（128°33′28.4″E，43°46′39.9″N）-湖北桥西（128°34′34.0″E，43°43′11.1″N）-楼上村（128°33′36.0″E，43°45′40.6″N）-大崴子（128°33′24.3″E，43°44′49.6″N）-牛场（128°33′24.3″E，43°43′45.9″N）-前旋（128°34′35.6″E，43°43′31.1″N）-西弯（128°34′34.0″E，43°43′11.1″N）-鸭场弯（128°35′59.9″E，43°42′29.0″N）-大山水库坝西（128°35′23.3″E，43°41′19.7″N）。核心区范围在东经128°32′04″-128°33′43.2″，北纬43°41′43.9″-43°46′9.5″之间，实验区范围在东经128°33′36″-128°38′49.5″，北纬43°45′40.9″-43°41′43.9″之间。主要保护对象为黑斑狗鱼、江鳕、瓦氏雅罗鱼，其他保护物种包括东北雅罗鱼、翘嘴红鲌、细鳞斜颌鲴、蒙古红鲌、银鲴等。