北京师范大学生命科学学院教授(个人简介 主要研究内容 代表性论著)

历史人物(人物简介 作品一览)

北京师范大学生命科学学院教授

林魁（博士，1963年7月出生），教授、博士生导师。

个人简介

1983年本科毕业于兰州大学数力系；1990年兰州大学理学硕士毕业（应用数学）；1997年兰州大学理学博士毕业（理论生态学）；1998年1月－1999年1月在新加坡国立大学生物信息学中心(BIC, NUS)作博士后；1999年2月－2000年1月在新加坡国立大学生物信息学中心(BIC, NUS)工作(Research Fellow)；2000年2月－2001年10月在新加坡分子与细胞生物学研究院(Institute of Molecular & Cell Biology)工作(Research Fellow)；2001年11月－2002年8月在新加坡基因组研究院(Genome Institute of Singapore)工作(Research Scientist)；2002年8月至今，北京师范大学生命科学学院教授。目前林教授担任北师大生命科学学院工会主席。

2005年之后，林魁教授科研成绩卓越，以通讯作者身份分别在Trends in Genetics，Nucleic Acid Research和Ecology等国际超一流杂志上发表多篇论文，在研究界取得巨大反响。2009年，林魁教授小组还合作在Nature Genetics上发表研究论文。

主要研究内容

微生物基因组的进化：主要利用微生物基因组特别是原核生物基因组内普遍存在的重叠基因作为遗传标记，同时结合其它系统发育标记在全基因组水平上进行基因组间进化关系的系统发育分析；

蛋白与蛋白相互作用网络的构建与分析：在全基因组水平上设计新的计算和分析方法，构建高质量的网络并同时得到高可靠性的负数据集。该方法已成功应用于酵母菌基因组；

蛋白质相似性比较分析：在蛋白质结构域架构（Protein Domain Architecture）的水平上设计算法进行蛋白质相似性比较研究，试图在基因的水平上探讨结构域架构间的进化关系。

此外，林魁教授的研究还涉及到微生物群落基因组学、人类基因组中遗传变异数据的分析、真核生物内含子进化以及microRNAs与其靶基因间的关系等问题。

代表性论著

Wu, X.M., Zhu, L., Guo, J., Fu, C., Zhou, H.J., Dong, D., Li, Z.B., Zhang, D.Y. and Lin, K. (2006) SPIDer: Saccharomyces protein-protein interaction database. BMC Bioinformatics 7, S16.

Luo, Y.Q., Fu, C., Zhang, D.Y. and Lin, K. (2006) Overlapping genes as rare genomic markers: the γ-Proteobacteria phylogeny as a case study. Trends in Genetics 22(11): 593-596.

Lin, K., Zhu, L. and Zhang, D.Y. (2006) An initial strategy for comparing proteins at the domain architecture level. Bioinformatics 22(17): 2081-2086.

Wu, X.M., Zhu, L., Guo, J., Zhang,D.Y. and Lin, K. (2006) Prediction of yeast protein-protein interaction network: insights from the Gene Ontology and annotations. Nucleic Acids Research 34(7): 2137-2150.

Lin, K. and Zhang, D.Y. (2005) The excess of 5' introns in eukaryotic genomes. Nucleic Acids Research 33: 6522-6527.

历史人物

林魁[明]（约公元一五一五年前后在世），字廷元，自号白石山人，龙溪人。生卒年不详，约明武宗正德十年前后在世。

人物简介

弘治十五年（公元一五o二年）进士。历户部郎中。永寿伯朱德见幸，武宗欲废太平仓赐之，魁力谏。西僧大乘法王夺民田，劾其不法。官至云南兵备副使。魁有学行，诗亦俊逸。

作品一览

著有白石野稿十七卷，《四库总目》行于世。