rDNA，即核糖体DNA。rDNA 就是可以转录产生rRNA的基因，rDNA的活性改变在核仁周期（也就是细胞分裂过程中核仁的消失与重建）中发挥着重要作用。它不是单独存在的，有时候它可以和别的基因间隔分布，比如可以和tDNA间隔。

特征

微生物鉴定

其它

特征

rDNA是编码核糖体RNA的基因，其测定序列常用来鉴定物种同源性，和鉴别物种可以通过PCR技术和荧光染色技术结合准确定位基因位置。核糖体被誉为“细胞的蛋白质工厂”，rDNA所编码的蛋白质就是核糖体蛋白。在普通的细胞中，存在着超过100个rDNA重复序列，而且它们相当不稳定。这些重复序列彼此之间很容易发生重组，而在人体内，这种重组则会导致多种疾病(例如，癌症和亨廷顿舞蹈症)。核糖体内不存在DNA。rDNA是指核DNA中编码核糖体蛋白的DNA序列，只是长链DNA序列中的一段，不存在一条DNA序列只编码核糖体蛋白。所以rDNA是不会单独存在的。

rRNA一般存在于细胞核的核仁组织区，在转录完毕后结合成核糖体的大小两个亚基并在细胞质中与mRNA结合形成核糖体。在叶绿体和线粒体里也有部分rRNA。

微生物鉴定

随着生物技术的飞速发展, 传统的微生物鉴定方法常常难以鉴定众多的生长习性复杂的微生物,因而基于基因组序列的分子鉴定受到广泛关注。在细菌基因组中, 编码 16S rRNA 的 rDNA 基因具有良好的进化保守性, 适宜分析的长度( 约为 1 5kb), 以及与进化距离相匹配的良好变异性,所以成为细菌分子鉴定的标准标识序列。目前 16SrDNA 的序列信息已经广泛应用于菌种鉴定和系统发生学研究。

根据细菌的16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的高度保守区设计引物，PCR扩增了2株创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(Intergenic spacer,IGS)，克隆到pGEM-T载体上。测序是用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析。结果表明，2株创伤弧菌共测出9条16S-23S rDNA间区序列,其中ZSU006测出5条，间区类型分别为：IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG.其中IGSGLAV最大，包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因；IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因；IGSIn,则包含tRNAIle和tRNAAla基因；IGSG仅包含tRNAGlu基因；而IGSA仅包含tRNAAla基因。菌株CG021测出的16S-23S rDNAIGS序列有4条，除缺少IGSA外，其余的IGS类型均与ZSU006的相同。与GenBank内的创伤弧菌ATCC27562的IGS序列比较，发现创伤弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性。16S-23S rDNA间区结构的差异为建立一种新的创伤弧菌检测方法奠定了基础。

采用CPD（PI和DAPI组合）染色对番茄减数分裂粗线期和有丝分裂中期染色体进行了显带分析，随后用两种不同的45S rDNA 克隆在相同的分裂相进行了荧光原位杂交定位分析。CPD 染色在8条粗线期染色体上显示出了10条红色的CPD 带纹，在6对有丝分裂中期染色体上显示出了12条CPD带纹。有丝分裂中期染色体上的CPD带纹与粗线期染色体上显要的带纹具有对应性。用改良的CPD染色程序清晰而稳定地显示出的这些特征性的CPD带纹，为番茄的染色体，特别是有丝分裂中期染色体提供了新的识别标记。用番茄的一个45S rDNA 克隆进行的荧光原位杂交，不仅在位于2号染色体短臂的随体上显示了强的杂交信号，而且在粗线期染色体的5个CPD带区或有丝分裂中期染色体的4对CPD带区显示了弱的杂交信号。然而，用来自小麦的45S rDNA 克隆 pTa71进行的原位杂交却只在随体上显示了杂交信号。鉴于所用的两个45S rDNA 克隆在序列上的差异，推断在番茄基因组中只有随体含有45S rDNA 单位的编码区，即番茄只有一对45S rDNA位点。

其它

结构基因（structural gene）是指某些能决定某种多肽链（蛋白质）或酶分子结构的基因。结构基因的突变可导致特定蛋白质（或酶）一级结构的改变或影响蛋白质（或酶）量的改变。

调控基因（regulator and control gene）是指某些可调节控制结构基因表达的基因。调控基因的突变可以影响一个或多个结构基因的功能，或导致一个或多个蛋白质（或酶）时的改变。

此外，还有一些只转录而不翻译的基因，如核糖体RNA基因（ribosomal RNA gene），也称为rDNA基因，它们专门转录rRNA；还不转运RNA基因（transfer RNA gene），也称为tRNA基因，是专门转录tRNA的。